Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Skap2Q3UND0 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms