Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms