Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm648Q3UJ22 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms