Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Nkx6-3Q3UHX8 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Nkx6-3Q3UHX8 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Nkx6-3Q3UHX8 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Nkx6-3Q3UHX8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Nkx6-3Q3UHX8 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Nkx6-3Q3UHX8 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Nkx6-3Q3UHX8 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms