Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Snx27Q3UHD6 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Snx27Q3UHD6 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Snx27Q3UHD6 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Snx27Q3UHD6 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Snx27Q3UHD6 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Snx27Q3UHD6 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Snx27Q3UHD6 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Snx27Q3UHD6 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Snx27Q3UHD6 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Snx27Q3UHD6 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Snx27Q3UHD6 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx27Q3UHD6 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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