Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Puf60Q3UEB3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms