Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms