Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Sult1b1-203ENSMUST00000120150 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r-ps102-201ENSMUST00000120663 886 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27817-201ENSMUST00000184302 233 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37317-201ENSMUST00000192198 1024 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45458-201ENSMUST00000209900 522 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 AC159476.2-201ENSMUST00000216221 418 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm39307-201ENSMUST00000216780 1037 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 4930515L19Rik-201ENSMUST00000152352 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27155-201ENSMUST00000183716 898 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29318-201ENSMUST00000185308 975 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42794-201ENSMUST00000197636 835 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 AC153729.2-201ENSMUST00000215166 560 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm34237-201ENSMUST00000220575 1257 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Cd40lg-201ENSMUST00000033466 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10330-201ENSMUST00000072014 1354 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7416-201ENSMUST00000117448 1487 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtpbp6Q3U6U5 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms