Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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Q3U6N9 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q3U6N9 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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