Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf40Q3U319 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnf40Q3U319 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Rnf40Q3U319 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf40Q3U319 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf40Q3U319 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf40Q3U319 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf40Q3U319 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Rnf40Q3U319 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf40Q3U319 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf40Q3U319 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Rnf40Q3U319 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms