Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srsf6Q3TWW8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms