Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hddc2Q3SXD3 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
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