Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Tmem30c-203ENSMUST00000120112 3478 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm45889-202ENSMUST00000211255 2358 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Zfp959-201ENSMUST00000054780 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Mtfr1-204ENSMUST00000130645 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Olfr169-203ENSMUST00000215476 2476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccbe1Q3MI99 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms