Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rtl9Q32KG4 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.1 ms