Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Col24a1Q30D77 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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Col24a1Q30D77 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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Col24a1Q30D77 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Col24a1Q30D77 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Col24a1Q30D77 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Col24a1Q30D77 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Col24a1Q30D77 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Col24a1Q30D77 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Col24a1Q30D77 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Col24a1Q30D77 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Col24a1Q30D77 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm12972-201ENSMUST00000152986 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col24a1Q30D77 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms