Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Vax1Q2NKI2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms