Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Samd11Q1RNF8 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Samd11Q1RNF8 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms