Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim71Q1PSW8 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms