Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Spatc1Q148B6 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Spatc1Q148B6 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Spatc1Q148B6 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Spatc1Q148B6 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Spatc1Q148B6 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Spatc1Q148B6 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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