Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gli2Q0VGT2 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms