Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vps8Q0P5W1 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms