Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Znf541Q0GGX2 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.1 ms