Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm1Q0GA42 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms