Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Tff1Q08423 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Tff1Q08423 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Tff1Q08423 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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