Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnn1Q08091 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms