Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
NrepQ07475 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
NrepQ07475 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Aff1-202ENSMUST00000054979 8323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
NrepQ07475 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Zbtb26-201ENSMUST00000067043 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Cacna1c-208ENSMUST00000187317 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Tfap2b-201ENSMUST00000027059 5863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Kat6b-207ENSMUST00000182855 6791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
NrepQ07475 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms