Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah1bQ06985 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms