Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Tmem156-201ENSMUST00000043352 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 mt-Rnr2-201ENSMUST00000082390 1582 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Mup6-201ENSMUST00000107517 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm21083-201ENSMUST00000188807 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm37989-201ENSMUST00000195202 803 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 AC142113.2-201ENSMUST00000217425 748 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Cep19-203ENSMUST00000169186 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Iyd-201ENSMUST00000019896 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm45210-201ENSMUST00000206401 1577 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm26401-201ENSMUST00000158502 76 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 AC153526.1-201ENSMUST00000219750 190 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox12Q04890 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms