Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff2Q03404 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff2Q03404 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms