Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cacna1sQ02789 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cacna1sQ02789 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms