Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VcpQ01853 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VcpQ01853 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VcpQ01853 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VcpQ01853 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VcpQ01853 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VcpQ01853 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VcpQ01853 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VcpQ01853 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VcpQ01853 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VcpQ01853 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms