Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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EgfrQ01279 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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EgfrQ01279 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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EgfrQ01279 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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EgfrQ01279 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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EgfrQ01279 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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EgfrQ01279 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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EgfrQ01279 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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EgfrQ01279 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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EgfrQ01279 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EgfrQ01279 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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EgfrQ01279 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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