Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb2Q00977 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms