Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pax8Q00288 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms