Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smn1P97801 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smn1P97801 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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