Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H3f3aP84244 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
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