Protein–RNA interactions for Protein: P82349

Sgcb, Beta-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcbP82349 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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SgcbP82349 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcbP82349 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcbP82349 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcbP82349 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcbP82349 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcbP82349 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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SgcbP82349 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcbP82349 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcbP82349 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcbP82349 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcbP82349 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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SgcbP82349 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcbP82349 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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SgcbP82349 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcbP82349 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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SgcbP82349 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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SgcbP82349 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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SgcbP82349 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SgcbP82349 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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SgcbP82349 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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SgcbP82349 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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SgcbP82349 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcbP82349 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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SgcbP82349 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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SgcbP82349 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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SgcbP82349 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcbP82349 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcbP82349 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcbP82349 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcbP82349 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcbP82349 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcbP82349 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcbP82349 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcbP82349 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcbP82349 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcbP82349 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcbP82349 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SgcbP82349 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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