Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx1P80205 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx1P80205 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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