Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfi1P70338 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms