Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Acta1P68134 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Acta1P68134 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Acta1P68134 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Acta1P68134 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Acta1P68134 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Acta1P68134 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Acta1P68134 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Acta1P68134 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Acta1P68134 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Acta1P68134 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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