Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UbdP63072 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UbdP63072 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UbdP63072 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbdP63072 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UbdP63072 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms