Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps11P62281 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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