Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2kP61087 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms