Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P58686 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P58686 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P58686 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P58686 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P58686 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P58686 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P58686 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P58686 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P58686 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P58686 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P58686 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P58686 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P58686 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P58686 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P58686 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P58686 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P58686 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P58686 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P58686 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P58686 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P58686 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P58686 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P58686 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P58686 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P58686 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P58686 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P58686 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P58686 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P58686 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P58686 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P58686 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P58686 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P58686 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P58686 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P58686 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P58686 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P58686 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P58686 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P58686 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P58686 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P58686 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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