Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp25P57080 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp25P57080 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp25P57080 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp25P57080 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp25P57080 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp25P57080 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp25P57080 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp25P57080 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp25P57080 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp25P57080 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms