Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Lrtm1-203ENSMUST00000224760 3060 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sh3bp1P55194 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms