Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Lbx1P52955 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Lbx1P52955 Slc31a2-202ENSMUST00000107467 868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Lbx1P52955 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Lbx1P52955 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Lbx1P52955 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Lbx1P52955 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lbx1P52955 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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