Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc13P50207 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms