Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tmod1P49813 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms