Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ptx3P48759 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms